การทดสอบความชำนาญห้องปฏิบัติการ (Proficiency testing, PT) เป็นส่วนสำคัญที่ก่อให้เกิดกลไก การประกันคุณภาพห้องปฏิบัติการทดสอบ/สอบเทียบ และเป็นหนึ่งในวิธีการประเมินความสามารถของห้องปฏิบัติการ โดยการทดสอบและสอบเทียบวัตถุตัวอย่างด้วยวิธีการหนึ่งๆ เพื่อยืนยันความสามารถ และสร้างความมั่นใจในความใช้ได้ของผลการวัด (Ensuring the validation of results) ซึ่งเป็นหนึ่งในข้อกำหนดของระบบคุณภาพห้องปฏิบัติการตามมาตรฐาน IS0/IEC 17025 นอกจากนี้การเข้าร่วมโปรแกรมทดสอบความชำนาญห้องปฏิบัติการ ช่วยให้ห้องปฏิบัติการสามารถติดตามความสามารถ ทวนสอบเทคนิคการทดสอบ/สอบเทียบ เป็นการสร้างความเชื่อมั่นและความมั่นใจให้กับห้องปฏิบัติการและผู้รับบริการ การดำเนินงานตามภารกิจข้างต้นก่อให้เกิดกลไกการพัฒนา/ยกระดับโครงสร้างพื้นฐานทางวิทยาศาสตร์ วิจัย และนวัตกรรมของประเทศ อย่างยั่งยืน

ศูนย์ฯ มีนโยบายในการการดำเนินงานและทำหน้าที่เป็นผู้จัดโปรแกรมทดสอบความชำนาญห้องปฏิบัติการ ผลิตวัสดุอ้างอิง/วัสดุควบคุม ดำเนินภารกิจอย่างเป็นกลางโดยไม่เลือกปฏิบัติ เป็นองค์กรที่ไม่แสวงหากำไร ซึ่ง ศูนย์ฯ ได้รับการสนับสนุนจากรัฐบาล โดยค่าใช้จ่ายในการจัดโปรแกรมทดสอบความชำนาญห้องปฏิบัติการ การผลิตวัสดุอ้างอิง/วัสดุควบคุม ได้รับการจัดสรรจากเงินงบประมาณแผ่นดิน ทั้งนี้ รายได้ที่เกิดขึ้นจากการดำเนินงานตามภารกิจถือเป็นรายได้ของแผ่นดินที่ต้องนำส่งให้แก่กระทรวงการคลังตามกฎหมาย